Las primeras referencias a Holašovice datan ya del siglo XIII, en el período de colonización de la frontera sur de Bohemia. El municipio sufrió dos fuertes azotes. El primero de ellos llegó en el siglo XVI cuando prácticamente todos los habitantes checos originales sucumbieron a una epidemia de peste. Aunque prácticamente de forma inmediata fue repoblada con nuevos colonos alemanes. El segundo fue a principios de la segunda guerra mundial, cuando los esfuerzos de la población alemana local se vieron recompensados con la anexión del municipio al Reich. En el año 1946 tuvo lugar el éxodo obligatorio que afectó a la mayoría de habitantes de nacionalidad alemana. Los edificios vacíos fueron ocupados por ciudadanos checos del interior del país, que no tuvieron necesidad de construir nuevas casas, sino más bien de reparar y conservar las existentes. Prácticamente todo el sistema medieval de edificios y graneros bien conservados fue inscrito en la Lista de la UNESCO en el año 1998.
El pueblo Holašovice es un ejemplo de la tradicional aldea centroeuropea. La aldea mantiene en buena condición su original plano arquitéctónico medieval con muchas construcciones rurales que datan de los siglos XVIII y XIX y cuyo estilo es conocido como el "Barroco rural de Bohemia del Sur".